清代,桂素贞丧夫,其叔欲谋财害命,佳得昆仑剑侠沈栖霞相救,收为弟子,改名红姑。其侄佳武被峻顺派甘瘤子招为女婿,后佳武知其劣绩,携妻甘联珠逃出甘家。峻顺剑侠董禄堂与昆仑派罗汉吕宣良争斗,败归,心中不服,自此形成两派对立。红莲寺憎知圆私抢民女,被昆仑派弟子杨天池访知,欲惩之。湖广巡抚L文正私访,被知圆识破,遭囚禁。昆仑派柳迟、甘联珠、陆小青等引兵围寺,救出L文正,火烧红莲寺。知圆投靠腔恫派。以后的情节即围绕昆仑派和睦顺派之间的矛盾纠葛和争斗展开。
宋徽宗宣和七年, 皇帝多病朝纲不振,朝廷上太师专权。内侍太监刘公公利用劣绅甘瘤子暗中勾结金人, 乔装番僧窃据汴京城外红莲寺以图谋篡社稷。 隐士吕萱良虽然身在乡野, 但他爱国情切,探悉奸情后, 急命徒众红姑、陆小青、柳迟等人劝王救主。 刘公公率领叛军想要劫持太子, 但御林军统领黄义誓死效忠太子,并卫护太子逃出京城。 甘瘤子得到太师密令, 前去截劫太子的去路, 甘女联珠不齿父兄所为, 偕同桂武潜离甘家,参加到了勤王阵容中去。她的兄长联庆前往追截,被桂武和联珠击退。他们到李太发家与黄将军会合,保护太子安全。 太子等人一行到了十里坡,与甘瘤子、常德庆等相遇,展开了激烈的战斗, 最终因为众孤悬殊而不敌, 太子、联珠、桂武三人被俘。等红姑等赶到的时候, 甘等人已返还红莲寺。 而太师与刘公公也因奸谋暴露,而逃往红莲寺藏身, 吕萱良亲率红姑、柳迟等徒众,前往红莲寺救援太子。红莲寺内内密布机关,步步惊险,众人与甘瘤子等人展开生死血斗,打破了机关, 救出了太子、联珠、桂武三人, 最终将甘众歼灭,还搜出了太师刘公公二人,将他们带返汴京正法。联珠看到父亲尸体,亲情流露而悲痛不已,但是想到叛国罪孽难恕,也就释然了。 一场风波就此平息, 太子登基。
寺院于公元1230年由高僧嘛尼仁青的高徒迦卢巴旦曲丹增仁波切创建(西藏地方面临归附蒙古汗国时期)。在公元1265年八思巴从蒙古汗国丛局回来后,在此地寺院的基础上又修建了几座经堂等。公元1698年,邬坚桑丹仁波切奉上师阿旺洛桑嘉措生前的谐旨与毗卢遮那佛口谕,在怖畏金刚降魔地隆嘎山修建寺院:包括大殿一座、禅院三座、经院一座、汉藏学者经典著作库一座、上师殿一座、僧舍。塑造本尊、菩萨、上师像以及镏金彩绘六大密部所属坛城之寂怒本尊、空护法像极为庄严。在开光大典迎请诸佛圣众法会时,诸佛圣众像朗朗日轮降临融会到寺院,给寺院巨大的加持。当地的藏民信众看见红光普照,空中朵朵鲜花飘落,听闻侥钹之清脆妙音等等殊胜奇景,壮观美丽。寺院落成开光后,老寺院迁入新址。当时四众弟子遍布康藏,前来常住的僧人近450人。由于僧众不断增加,于公元1792年在隆嘎山下生达地方,由晋美腾秋旦巴朗杰仁波切建成了八十八根长拄组成的大殿,与前期寺院连成一体。于1985年又修建了五明佛学院一座,闭关院两座,从初始创建之今,生达佐钦寺已走过770年的光辉历程。众多大成就者都曾亲临本寺开光加持。如八思巴尊者维修过本寺院并开光;宗喀巴大师前藏时,路过本寺,在石岩上以神通用指写下六字真言及留下足印,宗喀巴大师赞叹本尊怖畏金刚地,长出柏松,之今还在。还有菖才旺王、萨迦法王、嘎玛巴、历代司徒活佛皆亲临渗桐让本寺开光加持。全知麦彭仁波切到达本寺时,曾亲见七佛尊容。智者嘎玛差美给神山进行开光,并对转此山的善因进行了释义。
佛教事业及传承生达佐钦寺的佛教事业,是以学习大小五明,弘扬释迦正法,传讲与修行显密甚深广大经、律、论三学。如《究竟一乘定性论》、《中观》、《大圆满》等。根据四众弟子根机,分别按次第传讲相应法轨趣入如理修行与通达。以戒学为基础,而修定,以修定而生智慧,最终证圆满无上大菩提。本寺之今有26代成就转世活佛,37代法台的传承,诸智者在此所成就的讲、修、行三功业殊胜无比,闻名遐迩,特别优秀者有精通显密二宗的大堪布查格西洛珠曲杰俄色,被称之为南方班智达的察查轮冲嘎玛朗杰;声学家晋美阳杰仁波切;医学家邬坚丹增;虹身成就者邬坚桑丹等。这些智者们在整个康藏地美名远扬。四世佐钦活佛晋美色西平措和五世晋美藤秋旦巴时代弘扬佛法的建树尤为重大,对各宗派圆融无偏见赢得众学者的赞扬,在此期间寺院、僧伽、修行法事等得到前所未有的发展。