火影中波风水门把阴九尾封印在自己体内是为了什么呢？

当时他的查克拉快耗尽了，已经没有办法完成完整的封印了，只能够分开进行封印。

因为村子需要九尾的力量来威慑其他国家，而且要想强大，必须有尾兽作为基础，所以波风水门把阴九尾封印在自己体内。

这样是为了以防万一，万一鸣人犯糊涂的时候，他可以及时制止。