奈克松油田开采深海油田遭到环保界的一致否定,于是克莉丝汀 吉婷斯和他助手摄影师杰克一起去采访该油田负责人彼得 贝瑞雪。期间他们在检查海底吸管的时候意外的发现了史前才有的生物。一日,他们乘坐升降器在海底观测,而潜艇驾驶员麦姿则驾驶潜艇钻孔探油却掉入了一个奇妙的洞穴之中,里面景色光怪陆离,绚丽异常。然而噩梦却开始了,某夜记者克莉丝汀为一阵震动吵醒,于是和杰克及医师兼安全主任帕克斯、工程师麦金尼、潜水员艾略特共同乘坐升降器到海底观察,而麦姿和葛瑞迪则驾驶潜艇,就在这时一个庞然大物出现了,却是存在于六千五百万年前的史前巨鲨巨齿鲨,在葛瑞迪葬身鱼腹之后众人纷纷逃命,却不想巨齿鲨被震动所吸引,不停撞击下,众人不得不解开升降器铁锁,任其上升到海面,由直升机解救,这时麦姿用潜艇在将他们顶到冰块之上后遭到了鲨鱼的攻击终于还是被吞噬掉了,而麦金尼由于在上升过程中脚受了重伤,行动不便也遭到鲨鱼毒手。艾略特悲痛欲绝,在心爱女友和同伴相继遭鲨鱼残害之后,他决定用炸弹灭杀这条史前狂鲨,于是在帕克斯的帮助下,他驾驶潜艇下到海底与鲨鱼一番大战并同归于尽。
生化制药厂的老板法兰克林(山缪杰克森饰),是海底研究中心的赞助金主。他提供庞大资金让苏珊麦博士(莎佛朗布洛丝饰)研究抗老年疑呆症的神奇药丸。麦博唤改士与他的研究小组在孤立海中的海底研究中心,以最古老的生物--鲨鱼为实验对象,取其脑中蛋白质,注入人类坏死脑细胞,以完成伟大的医学成就。但法兰克林因为投资失利,预备终结研究中心的经费赞助,这对于成功在望的麦博士而言不啻是一个重大的打击。在努力说服下,法兰克林只好要求尽速看到成果,并且前来研究室目睹他们的成就。这时候暴风雨也正在缓缓的向海底研究中心逼近……
为达到目的,麦博士早已加大鲨鱼的脑容量,以萃取更多脑蛋白,但同时鲨鱼也逐渐变的明樱聪明,并且越来越强壮。但这不为人知的改变只有麦博士和鲨鱼朝夕相处的潜水夫卡特(汤玛斯杰恩饰)察觉。
虽然卡特曾向苏珊麦提出警语,但苏珊麦为使得实验正常进行,置之不理。终于,在最后一次的成功实验中,向人类展开致命的报复,救援直升机在风雨中赶到,却也不幸被聪明的巨鲨袭击,一场不可避和槐判免的大灾难于是展开。他们该如何对抗自己创造出来的变种恶鲨,谁又能从这险境中死里逃生?!
影片讲述了五条经过基因改造的牛鲨,在一个孤立的研究设施上给一群科学家造成了巨大的破坏的故事。