为什么晚上,中高层的楼房顶上都有红灯闪烁.

多数为信号灯，有关法规规定一定高度的建筑物要安装信号灯避免发生飞机碰撞等事故。

是为了防止夜间低空飞行的飞机因视线不清而撞到高层建筑

　　这些灯一般都是航空障碍灯，每分钟闪动20至70次，可以在夜晚、雨天、雾天等能见度比较低的气象条件下闪动照亮，为飞机导航，防止飞机误判航线。
　　1、按有关规定，为了飞行安全，飞机场附近都设有禁空保护区。这些禁空保护区，有散形、斜线、直线，在禁空区的建筑物，根据安全需要，都要安装航空障碍灯。
　　2、因安装在建筑物顶端，不会对住宅内的居民造成影响。
　　3、按国家标准,顶部高出地面45米以上的高层建筑必须设置航标灯。
　　4、为了与一般用途的照明灯有所区别,航标灯不是长亮着而是闪亮,闪光频率不低于每分钟20次,不高于每分钟70次。也就是警告那些飞机等:那里有个高层建筑,注意避开。

防止直升飞机等低飞物与之发生碰撞。

多数是信号发射塔之类的，有些是装饰灯，还有就是给飞机导航，有些飞机会飞的较低