商周至战国之时,为西南夷邛都国地。
西汉元鼎六年(公元前111年)在境内建会无、三绛2县,隶属越嶲郡。
晋武帝太康二年(公元前281年),移越琅郡治会无县,裁三绛县并入会无县。
刘宋之时,郡治移还邛都,其后会无县废治。
唐太宗贞观八年(公元前634年)在境内设和集县。高宗上元二年又于会无县故治设会川县,玄宗天宝初又于县侧设会同军。至德元年,会川为南诏蒙氏所据,设会川都督府,辖清宁郡。大理时期改会川府,下辖有泸州、隆州、黎溪、永昌、会理5州。
元世祖至元十二年(1275年)置会川路总管府,辖黎溪、姜州、通安、永昌、武安、隆州、会理、麻龙8管民千户。至元十七年在会川归依城设永昌州、改龙泥千户为武安州、改麻龙千户为麻龙州。至元二十七年(1275年)后,会川路领武安、永昌、麻龙、黎溪、会理5州。
明洪武十五年(1382年)改会川路设会川府,洪武二十五年(1392年)废府,改设会川军民宋御千户所,隶建昌卫,洪武二十七年改设会川卫民军指挥使司。
清康熙元年(1662年)改设会川卫军民守备,隶属建昌监理厅,康熙二十九年于卫东大桥复置会理州。雍正六年,裁会川卫守备,移会理州治卫所,隶属宁远府。宣统元年,境内披砂、苦竹、者保、通安、会理村5土司改土归流。
民国二年(1913年)会理州改县,民国二十四年(1935年)隶属第十八行政督察区,民国二十八(1939年)年划属西康省。1950年3月23日会理解放后,成立会理县临时工作委员会,对国民党旧政权进行军事接管。西昌专区成立后,会理属西昌专区。1978年随西昌地区建制撤销划入凉山州。