因为蒙古铁骑即将南下,郭靖等人等难以匹敌,关键时刻,小龙女和杨过无意中卷入纷争,打败金轮国师。但好事多磨,杨过与小龙女多次聚散,在经历了武林大会、襄阳鏖兵,绝情幽谷等等险境后,更有十六年的生离死别。十六年后痴情的杨过终于在绝情谷底找到了大难不死的小龙女,二人重返世间。此时蒙古正调集人马,猛攻襄阳,杨过击败了金轮法王,并以飞石击毙了蒙古皇帝蒙哥,为襄阳保卫战的胜利立下首功,战事结束,杨过小龙女告别郭靖等人,带着神雕,悠然远去。
杨过等人在击退蒙古军后,去到华山上见一群小喽啰进行着“第三次华山论剑”,杨过吓退他们,并与同伴谈论新的天下五绝,遂重订天下五绝为:“东邪——黄药师 , 西狂——杨过,南僧——一灯,北侠——郭靖,中顽童——周伯通。”下华山时,遇上少林派觉远与弟子张君宝向潇湘子、尹克西追讨《楞伽经》与《九阴真经》,杨过暗助张君宝打败潇湘子后,携小龙女告别众人离去......